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Spring GBADs Informatics Herd Round-Up

· 5 Minuten Lesezeit
Grace Patterson

Header-Bild

GBADs Informatik hat im Jahr 2022 viele neue Experten hervorgebracht, die über ein breites Spektrum an Talenten und Interessen verfügen. Gemeinsam treibt die „Herde“ aus 7 studentischen Entwicklern, 2 Doktoranden und 4 Postdoktoranden und wissenschaftlichen Mitarbeitern unsere Ziele in GBADs voran und erforscht neue Wege, um GBADs zu verbessern und den Nutzen des Programms auf kreative Weise zu steigern. Schauen Sie sich unser aktuelles Team im Abschnitt Über der Website an und lesen Sie weiter unten mehr über die Arbeit unseres Teams im Frühjahrssemester!

Das A und O der Wissensmaschine

Kassy hat eine Graphendatenbank aufgebaut, um die Auffindbarkeit von Daten zu verbessern und die Interoperabilität der zu analysieren Datenquellen, die GBADs sammelt. Außerdem war sie damit beschäftigt, Studierende bei ihrer Arbeit zu unterstützen, sich mit anderen Themen zu befassen, um den Fortschritt aufrechtzuerhalten, und als Datasphere Initiative Fellow die Bekanntheit von GBADs und FAIR-Daten zu verbreiten – sehen Sie sich einige ihrer jüngsten Präsentationen auf unseren [Highlights] an (http:/ /gbadskedoc.org/highlights) oder unsere Präsentationen und Veröffentlichungen.

Amardeep hat einen modularen Ansatz zur Dashboard-Erstellung entwickelt und Tutorials erstellt, damit jeder lernen kann, wie man ein einfaches Dashboard im GBADs-Stil erstellt. Sie können auf seine Tutorials im Abschnitt docs dieser Website zugreifen.

Nitin hat an der Infrastruktur für Berechtigungen und Zugriffsbeschränkungen gearbeitet, die erforderlich ist, um sicherzustellen, dass GBADs-Daten sicher sind, und dass wir Zugriffsbeschränkungen für verschiedene Benutzer anwenden können, die auf das Datenportal der Wissensmaschine zugreifen möchten. Diese Infrastruktur wird für die Aufrechterhaltung der Sicherheit privater Daten von entscheidender Bedeutung sein.

Rehan ist unser Experte für Viehbestandsdaten geworden, die aus den PDF-Berichten der Zentralen Statistikbehörde Äthiopiens stammen. Er hat diese Daten zum ersten Mal in einer Datenbank verfügbar gemacht und arbeitet an der Entwicklung von Berichten, um Trends auf regionaler und nationaler Ebene zu vergleichen und Datendiskrepanzen zu identifizieren. Er hat auch daran gearbeitet, diese Daten mit globalen Daten zu vergleichen. Berichte folgen in Kürze. Sehen Sie sich an, wie Sie über unsere [API] (http://gbadske.org/api/dataportal/) auf Details zugreifen können!

Polieren unserer Produkte

Matthew hat viel Arbeit in die Entwicklung und Einführung dieser Website zur Dokumentation der GBAD-Ressourcen, Tutorials, Dokumentationen und Präsentationen gesteckt. Die Seite wird ständig weiterentwickelt und es wird immer mehr Material hinzugefügt. Schauen Sie also regelmäßig vorbei!

Kurtis begann mit uns zusammenzuarbeiten, um das Design unserer Dashboards und Visualisierungen zu verbessern und einen zusammenhängenden visuellen Standard zur Verwendung in allen GBADs zu entwickeln. Seine Styleguides wurden über andere Themen hinweg und mit externen Partnern wie First Analytics geteilt.


GBADs Gif

(GIF mit freundlicher Genehmigung von Kurtis Sobkowich)

Themenübergreifende Zusammenarbeit

Grace arbeitete mit dem Thema „Menschliche Gesundheit“ zusammen, um einen Ansatz zu entwickeln, um Veränderungen der Nutztiergesundheit mit den Auswirkungen auf die menschliche Ernährung zu verknüpfen. Sie schrieb auch einen Blog über die Herausforderungen bei der Quantifizierung gesundheitliche Auswirkungen des Verzehrs tierischer Lebensmittel.

William passte schnell ein Python-Modul für die Expertenermittlung (Anduryl) an, um in R zu funktionieren. Er teilte dies dem Team mit, das an der äthiopischen Fallstudie arbeitete und es in ihren jüngsten Workshops einsetzte. Sein Tutorial zur Software finden Sie hier.

Le konnte sich schnell über die Fortschritte bei der Graphdatenbank und der Ontologie informieren und arbeitete mit dem Thema „Ontologie und Attribution“ zusammen, um Möglichkeiten zur Verbesserung der Interoperabilität von Daten aus verschiedenen wichtigen Datenquellen zu entwickeln. Sie arbeiten auch daran, Ontologien auf Datenbanken abzubilden.

Kassy und Deb arbeiteten mit Yin aus dem Thema Populationen und Produktionssysteme zusammen, um ihre Biomasseberechnungen und den Code für die Verwendung mit verschiedenen Datenquellen und für die Einbindung in die Wissensmaschine zu strukturieren.

Neue Grenzen erkunden

Cassandre hat NCBI nach genomischen Daten über Nutztierarten durchsucht, die zur Klassifizierung von Produktionssystemen verwendet werden könnten. Sie können sich ihr Seminar über ihre Arbeit [hier] ansehen (https://www.youtube.com/watch?v=5mwC4ngvxmc). Sie durchsucht auch andere Datenbanken, die nach ähnlichen Informationen zu Rassemerkmalen wie Größe und Gesundheitsmerkmalen durchsucht werden könnten.

Neila arbeitet an der Zukunft des Tierschutzes in GBADs. Sie hat mit Kollegen aus Liverpool zusammengearbeitet, um einen Vorschlag zur Einbeziehung dieses Themas in künftige Iterationen von GBADs zu entwickeln, Netzwerke mit Tierschutzexperten auf der ganzen Welt aufzubauen und das bestehende Datenökosystem zum Tierschutz zu erkunden. Lesen Sie ihre Einführung in die Tierschutzgesetzgebung in ihrem aktuellen Blog.

Zu guter Letzt leisteten Deb und Theresa weiterhin ihren Beitrag zur GBAD-Planung und führten die Herde zum Erfolg! Sie sind von entscheidender Bedeutung für die Problemlösung, die Verbindung mit Partnern und die Entwicklung unserer Roadmap für die Zukunft der GBAD-Informatik.

Sommervorschau

Halten Sie Ausschau nach einem Update zu unseren Sommeraktivitäten, zu denen auch die Einführung zahlreicher Dashboards gehört, dank des von Amardeep entwickelten Ansatzes:

  • Sky erstellt aktualisierte Dashboards für Bevölkerungs- und verschiedene Biomassestatistiken
  • Matthew und William arbeiten an einem Dashboard, um Berechnungen des wirtschaftlichen Gesamtwerts des weltweiten Viehbestands anzuzeigen, die im Rahmen des PPS-Themas erstellt wurden
  • Äthiopien-Datenstory-Dashboard von Rehan, Sky und Grace

Willkommen auch bei unserem neuesten Herdenmitglied Faraz, der an der „Datenheilung“ von OIE-Populationsdaten arbeitet. Willkommen auch bei Emily, die sich für den Sommerspaß der Herde angeschlossen hat!

Die Herde einholen

Wenn Sie GBADs Informatics in Aktion sehen möchten, stehen Ihnen zwei Möglichkeiten zur Verfügung. Schauen Sie sich die GBADs-Sitzung auf der SciDataCon am 22. Juni an, wo Deb, Kassy, und Le wird zusammen mit seinem Ontologie- und Attributionskollegen Stephen Kwok einen Vortrag halten. Das Thema Informatik wird an einer Sondersitzung zu GBADs teilnehmen und vom 7. bis 12. August drei Vorträge und vier Poster auf der ISVEE präsentieren. Wir werden eine Reihe von Themen behandeln, darunter metaontologische Rahmenbedingungen, Tierschutz, Lebensmittelsystemmodelle, interdisziplinäre Arbeit im Kontext von OneHealth, Auswirkungen von Datendiskrepanzen, Diagrammdatenbanken und eine Übersicht über wichtige Initiativen zur Datenaggregation. Wir hoffen, dich dort zu sehen!